مرکز تحقیقات بیماری‌های نوپدید و بازپدید جهت گسترش پژوهش و آموزش‌های مرتبط با بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید و پایش، تشخیص و کنترل این دسته از بیماری‌ها در کشور شکل گرفته است.

ﻣﺎﻣﻮرﻳﺖ این مرکز فراهم سازی اطلاعات درست و دانش به روز برای مسوولان و کارشناسان ایران و سایر کشورهای دنیا در حوزه بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید، ارائه مشاوره‌های فنی و تخصصی به وزارت بهداشت، دانشگاهیان و محققان کشور و سایر کشورها در حوزه بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید، پاسخ‏گویی مناسب به نیازهای کارشناسان ذی‌ربط در حوزه مراقبت، پایش و تشخیص بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید در سطح کشور و بین الملل،آموزش و ارتقاء سطح علمی موسسات و سازمان‌های مرتبط با پاسخ‏گویی در حوزه‌های نظام مراقبت، تشخیص و پایش بیماری‌های نوپدید و بازپدید در ایران و در سطح بین‌المللی، مشاوره و آموزش نظام مراقبت بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید به دست‏اندرکاران مرتبط در ایران و کشورهای دنیا، توسعه و بکارگیری علوم مرتبط با بیماری‌های عفونی نوپدید و بازپدید می باشد.

اعضای هیات علمی و کارشناسان بخش های تحقیقاتی مختلف انستیتو پاستور ایران و به طور خاص بخش های اپیدمیولوژی و آمارزیستی، آربوویروس‌های و تب‌های خونریزی دهنده ویروسی، انگل شناسی، باکتری شناسی، ایمونولوژی و ویروس شناسی با این مرکز همکاری می کنند. این مرکز دارای شعبه ای در روستای اکنلو در کبودرآهنگ همدان است که با نام پایگاه تحقیقاتی بیماری های نوپدید و بازپدید شناخته می شود و آزمایشگاه مرجع کشوری بیماری های طاعون، تولارمی و تب کیو است.